Lewat akun Twitter untuk anime Hataraku Saibou, diumumkan bahwa season kedua animenya akan mulai ditayangkan pada Januari tahun 2021. Mereka juga memperlihatkan PV dan visual baru untuk season kaduanya itu.
Selain itu diumumkan juga bahwa bahwa anime berdasarkan cerita dari volume 5 manga-nya akan ditayangkan di bioskop-bioskop di Jepang pada 5 September. Pengumuman itu menyatakan bahwa anime akan diputar di bioskop sebelum ditayangkan di TV sebagai bagian dari season kedua. Judul lengkap anime teater itu adalah: Tokubetsu Jōei-ban “Hataraku Saibō!!” Saikyō no Teki, Futatabi. Karada no Naka wa “Chō” Ōsawagi! Atau dalam bahasa Inggris: Special Screening Edition: “Cells at Work!” The Return of the Strongest Enemy. A Huge Uproar Inside the Body’s “Bowels!”
📢「はたらく細胞!!」第1弾PV公開🎥
またみんなに会える。体内細胞擬人化アニメ第2期、開幕!
2021年1月からのTV放送をお楽しみに✨🎦https://t.co/8wtCcZeRwh#はたらく細胞#アニプレックスTV pic.twitter.com/FFtx4lUVEl
— 『はたらく細胞』公式 (@hataraku_saibou) March 21, 2020
📢特報!🎬
『特別上映版「#はたらく細胞!!」最強の敵、再び。体の中は“腸”大騒ぎ!』
2020年9月5日(土)より劇場上映決定🎊TVアニメ第2期の中で描かれる原作コミックス第5巻のエピソードをオンエアに先駆け劇場上映いたします!
続報をお見逃しなく!🎦https://t.co/wNCAVqRsfI#アニプレックスTV pic.twitter.com/DvpPcyYGBh
— 『はたらく細胞』公式 (@hataraku_saibou) March 21, 2020

Hirofumi Ogura (Black Butler II, Null & Peta) adalah sutradara baru untuk season kedua, dan masih akan digarap di studio David Production. Yuuko Kakihara kembali untuk menulis skrip seri. Takahiko Yoshida kembali sebagai desain karakter, dan Kenichiro Suehiro dari Mayuko kembali untuk mengurus musik. Anime ini juga akan menampilkan seiyuu dari season sebelumnya.
Sinopsis:
Hataraku Saibou bercerita tentang kehidupan sehari-hari sekitar 60 triliun sel tubuh yang ada didalam tubuh manusia yang difokuskan tentang pertemanan sel darah merah dan sel darah putih, dimana sel darah merah tampak digambarkan seperti kurir pengantar barang dan sel darah putihnya tampak seperti seorang anggota dari pasukan khusus dengan seragam berwarna putih dan tampang serius yang sering direpotkan dengan masuknya virus dan bakteri kedalam tubuh.
Hataraku Saibou adalah sebuah seri manga yang ditulis dan diilustrasikan oleh Akane Shimizu. Seri ini merupakan antropomorfikasi sel-sel dalam tubuh manusia. Manganya telah diserialisasikan di majalah shōnen Kodansha yang bernama Monthly Shōnen Sirius mulai Maret 2015. Sebuah seri adaptasi anime oleh David Production mengudara pada tanggal 7 Juli 2018 sampai 29 September 2018.[edua sedang dalam tahap produksi.